В Москве корень имбиря продается в любом более-менее приличном сетевом супермаркете в отделе овощей.
У меня в радиусе 10 минут от дома Патерсон, Перекресток, Виктория - во всех них есть имбирь, где-то лежит прямо горой, где-то расфасован в пластиковые лотки, затянутые пленкой (в лотке их много, нормальному человеку столько не надо).
Если имбирь расфасован, а нужен обычно один корешок, подходим к девушке, стоящей на весах овощного отдела, и говорим ей, что нужен всего один корешок, при ней вскрываем расфасовку, вынимаем нужный корешок, оставшееся она перевешает и запакует по новой. Разлапистый корешок имбиря обычно "тянет" всего на 20-30 рублей.
Если пока глаз на имбирь не наметан, спрашивайте у девушек в овощном отделе супермаркета, они покажут - где.
В маркетах типа "Пятерочка" имбиря в Москве нет.
На рынке обычно продается на развес там же, где продают сухие специи (на рынке гораздо дороже, чем в супермаркете, т.к. там весы не электронные, а корешок реально весит всего ничего).

Полагаю, что в Питере ситуация от Москвы не отличается.